Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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