Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX21Q969T3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX21Q969T3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms