Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms