Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms