Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms