Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOSQ8NHW6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms