Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL11Q8NHH1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms