Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC82Q8N4S0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms