Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms