Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIX1LQ8IVB5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms