Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2Q1Q7Z7E8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms