Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms