Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG9AQ7Z3C6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms