Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q71RC1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q71RC1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q71RC1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms