Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINGO4Q6UY18 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms