Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VSTM1Q6UX27 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms