Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms