Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms