Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC41PQ6P2S7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms