Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms