Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms