Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms