Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms