Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms