Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GARNL3Q5VVW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms