Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGAP9Q5VTM2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms