Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CEP350Q5VT06 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP350Q5VT06 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms