Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDGFL1Q5TGJ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms