Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEND3Q5T5X7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms