Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms