Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms