Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALFQ53S48 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms