Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms