Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms