Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
QSER1Q2KHR3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms