Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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GEN1Q17RS7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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