Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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