Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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