Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SSX1Q16384 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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