Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F4Q16254 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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