Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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