Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SF1Q15637 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SF1Q15637 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SF1Q15637 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SF1Q15637 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SF1Q15637 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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