Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIX1Q15475 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms