Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-1Q15270 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX1-1Q15270 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
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