Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GPNMBQ14956 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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