Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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CHD4Q14839 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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CHD4Q14839 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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