Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX3Q13761 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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