Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA7Q13683 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms