Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms