Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms